Tarttoon voi matkustaa Tallinnan ja Riikan kansainvälisten lentokenttien kautta, matkustaen Tarttoon tilausajolla tai linja-autoliikenteen aikataulutetuilla reiteillä. Linja-autoliikenteestä saa lisätietoja alavalikosta Bussilla.
Tarton lentokentän ja kaupungin välillä toimii parhaiten taksiliikenne, ajosta voi maksaa erilaisilla puhelinsovelluksilla (edellyttää mobiilidataliikenteen käyttömahdollisuutta), mutta jos kaipaa vieläkin nopeampaa palvelua, voi taksin varata jo lennolta käsin, ilmoittaen toivomuksensa lentoemännälle. Taksiasema on lentoaseman edessä. Taksipalveluista saa lisätietoa alavalikosta Taksilla.